UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Pax63620chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
2Pax73593e-63chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
3Pax43556e-63chr6 28,445,843Mus musculus paired box 4 (Pax4), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011038)
4Pax33533e-61chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
5Pax23511e-58chr19 44,796,948Mus musculus paired box 2 (Pax2), transcript variant 7, mRNA. (from RefSeq NM_011037)
6Pax81529317e-57chr2 24,448,079Mus musculus paired box 8 (Pax8), mRNA. (from RefSeq NM_011040)
7Pax53571e-55chr4 44,617,622Mus musculus paired box 5 (Pax5), mRNA. (from RefSeq NM_008782)
8Pax93612e-44chr12 56,702,237Nucleus (By similarity). (from UniProt Q3V1K1)
9Pax13502e-44chr2 147,370,023Mus musculus paired box 1 (Pax1), mRNA. (from RefSeq NM_008780)
10Rax1835e-20chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
11Alx44402e-19chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
12Arx1419666e-19chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
13Prrxl131627e-19chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
14Alx32572e-18chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
15Vsx11824033e-18chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
16Dmbx117219e-18chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
17Alx12722e-17chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
18Prrx22664e-17chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
19Isx1837364e-17chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
20Uncx7405e-17chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
21Prrx12638e-17chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
22Phox2b1550439e-17chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
23Vsx22551e-16chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
24Phox2a1784e-16chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
25Otx11770.000000000000003chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
26Gsc1528410.00000000000001chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
27Crx1648000.000000000000008chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
28Otx21810.00000000000001chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
29Shox22530.00000000000003chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
30Mixl11462120.0000000000001chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
31Gsc218110.0000000000003chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
32Pitx22610.0000000000008chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
33Pitx3771310.000000000001chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
34Pitx11572990.000000000003chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
35Prop11875550.000000000003chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
36Otp2590.00000000003chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
37Nobox1793790.0000000005chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
38Hesx14070.0000000006chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
39Rhox13n/a0.0000000008chrX 38,125,593Mus musculus reproductive homeobox 13 (Rhox13), mRNA. (from RefSeq NM_001185002)
40Sebox2670.000000001chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
41Tlx11623420.000000002chr19 45,153,811Mus musculus T cell leukemia, homeobox 1 (Tlx1), mRNA. (from RefSeq NM_021901)
42Evx11497540.000000002chr6 52,315,938Mus musculus even-skipped homeobox 1 (Evx1), mRNA. (from RefSeq NM_007966)
43Meox23340.000000003chr12 37,144,037Mus musculus mesenchyme homeobox 2 (Meox2), mRNA. (from RefSeq NM_008584)
44Nkx6-31727800.000000002chr8 23,156,108Mus musculus NK6 homeobox 3 (Nkx6-3), mRNA. (from RefSeq NM_029002)
45Evx24200.000000004chr2 74,657,517Mus musculus even-skipped homeobox 2 (Evx2), mRNA. (from RefSeq NM_007967)
46Nkx1-1n/a0.000000005chr5 33,432,355Mus musculus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. (from RefSeq NM_011320)
47Gbx21574170.000000004chr1 89,929,567Mus musculus gastrulation brain homeobox 2 (Gbx2), mRNA. (from RefSeq NM_010262)
48Rhox8n/a0.000000005chrX 37,876,861Mus musculus reproductive homeobox 8 (Rhox8), mRNA. (from RefSeq NM_001004193)
49Duxbl11709950.000000009chr14 25,986,546Mus musculus double homeobox B-like 1 (Duxbl1), mRNA. (from RefSeq NM_183389)
50Gbx11550620.000000009chr5 24,514,979Mus musculus gastrulation brain homeobox 1 (Gbx1), mRNA. (from RefSeq NM_015739)