UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Pax43550chr6 28,445,843Mus musculus paired box 4 (Pax4), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011038)
2Pax63624e-64chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
3Pax33534e-50chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
4Pax73599e-50chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
5Pax23517e-44chr19 44,796,948Mus musculus paired box 2 (Pax2), transcript variant 7, mRNA. (from RefSeq NM_011037)
6Pax53578e-43chr4 44,617,622Mus musculus paired box 5 (Pax5), mRNA. (from RefSeq NM_008782)
7Pax81529314e-42chr2 24,448,079Mus musculus paired box 8 (Pax8), mRNA. (from RefSeq NM_011040)
8Pax93615e-37chr12 56,702,237Nucleus (By similarity). (from UniProt Q3V1K1)
9Pax13509e-37chr2 147,370,023Mus musculus paired box 1 (Pax1), mRNA. (from RefSeq NM_008780)
10Vsx11824030.00000000000002chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
11Rax1830.00000000000008chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
12Alx44400.0000000000001chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
13Dmbx117210.0000000000002chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
14Vsx22550.0000000000003chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
15Gsc218110.0000000000004chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
16Alx32570.0000000000005chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
17Gsc1528410.000000000003chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
18Alx12720.000000000005chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
19Prop11875550.00000000001chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
20Pitx22610.00000000002chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
21Pitx11572990.00000000003chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
22Pitx3771310.00000000003chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
23Prrxl131620.00000000003chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
24Arx1419660.00000000004chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
25Isx1837360.00000000007chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
26Mixl11462120.0000000001chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
27Prrx12630.0000000001chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
28Uncx7400.0000000005chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
29Prrx22660.0000000008chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
30Sebox2670.000000001chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
31Phox2a1780.000000001chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
32Rhox13n/a0.000000001chrX 38,125,593Mus musculus reproductive homeobox 13 (Rhox13), mRNA. (from RefSeq NM_001185002)
33Otx11770.000000002chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
34Phox2b1550430.000000004chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
35Nobox1793790.000000004chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
36Crx1648000.000000004chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
37Evx24200.000000007chr2 74,657,517Mus musculus even-skipped homeobox 2 (Evx2), mRNA. (from RefSeq NM_007967)
38Evx11497540.000000008chr6 52,315,938Mus musculus even-skipped homeobox 1 (Evx1), mRNA. (from RefSeq NM_007966)
39Emx11502420.00000001chr6 85,195,898Mus musculus empty spiracles homeobox 1 (Emx1), mRNA. (from RefSeq NM_010131)
40Otx21810.00000001chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
41Hmx140.00000001chr5 35,391,003Mus musculus H6 homeobox 1 (Hmx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_010445)
42Obox8n/a0.00000001chr7 14,332,496Obox8 (from geneSymbol)
43Hoxd43920.00000002chr2 74,725,569Mus musculus homeobox D4 (Hoxd4), mRNA. (from RefSeq NM_010469)
44Hoxa51530200.00000003chr6 52,203,170Mus musculus homeobox A5 (Hoxa5), mRNA. (from RefSeq NM_010453)
45Emx24180.00000003chr19 59,461,864Mus musculus empty spiracles homeobox 2 (Emx2), mRNA. (from RefSeq NM_010132)
46Dbx21838000.00000003chr15 95,639,761Mus musculus developing brain homeobox 2 (Dbx2), mRNA. (from RefSeq NM_207533)
47Msx13280.00000003chr5 37,822,534Mus musculus msh homeobox 1 (Msx1), mRNA. (from RefSeq NM_010835)
48Gbx21574170.00000004chr1 89,929,567Mus musculus gastrulation brain homeobox 2 (Gbx2), mRNA. (from RefSeq NM_010262)
49Tlx11623420.00000005chr19 45,153,811Mus musculus T cell leukemia, homeobox 1 (Tlx1), mRNA. (from RefSeq NM_021901)
50Shox22530.00000005chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)