UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Otx21812e-140chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
2Crx1648004e-53chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
3Otx11771e-50chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
4Prrxl131623e-20chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
5Phox2b1550433e-19chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
6Phox2a1788e-19chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
7Dmbx117218e-19chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
8Pitx11572995e-17chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
9Arx1419664e-17chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
10Rax1831e-16chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
11Mixl11462121e-16chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
12Shox22531e-16chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
13Alx12722e-16chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
14Pax63623e-16chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
15Alx44405e-16chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
16Pax33530.000000000000001chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
17Pax73599e-16chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
18Uncx7400.000000000000001chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
19Alx32570.000000000000002chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
20Pitx3771310.000000000000002chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
21Pitx22610.000000000000002chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
22Otp2590.000000000000005chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
23Isx1837360.000000000000005chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
24Vsx11824030.000000000000007chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
25Gsc1528410.000000000000009chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
26Gsc218110.00000000000004chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
27Prrx22660.00000000000005chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
28Prop11875550.00000000000006chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
29Prrx12630.0000000000001chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
30Sebox2670.000000000004chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
31Vsx22550.00000000001chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
32Hesx14070.00000000002chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
33Duxbl11709950.00000000004chr14 25,986,546Mus musculus double homeobox B-like 1 (Duxbl1), mRNA. (from RefSeq NM_183389)
34Duxbl31709950.00000000004chr14 26,265,847Mus musculus double homeobox B-like 3 (Duxbl3), mRNA. (from RefSeq NM_001177539)
35Duxbl21709950.00000000004chr14 26,126,186Mus musculus double homeobox B-like 2 (Duxbl2), mRNA. (from RefSeq NM_001177538)
36Esx12710.00000000007chrX 137,117,861Mus musculus extraembryonic, spermatogenesis, homeobox 1 (Esx1), mRNA. (from RefSeq NM_007957)
37Meox13330.000000002chr11 101,885,942Mus musculus mesenchyme homeobox 1 (Meox1), mRNA. (from RefSeq NM_010791)
38Rhox13n/a0.000000003chrX 38,125,593Mus musculus reproductive homeobox 13 (Rhox13), mRNA. (from RefSeq NM_001185002)
39Meox23340.000000006chr12 37,144,037Mus musculus mesenchyme homeobox 2 (Meox2), mRNA. (from RefSeq NM_008584)
40Pax43550.00000001chr6 28,445,843Mus musculus paired box 4 (Pax4), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011038)
41Nkx1-1n/a0.00000003chr5 33,432,355Mus musculus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. (from RefSeq NM_011320)
42Nkx1-23460.00000005chr7 132,597,257Mus musculus NK1 homeobox 2 (Nkx1-2), mRNA. (from RefSeq NM_009123)
43Rhox12n/a0.00000005chrX 38,107,492Mus musculus reproductive homeobox 12 (Rhox12), mRNA. (from RefSeq NM_001025083)
44Evx11497540.00000008chr6 52,315,938Mus musculus even-skipped homeobox 1 (Evx1), mRNA. (from RefSeq NM_007966)
45Pdx11406220.00000009chr5 147,272,903Mus musculus pancreatic and duodenal homeobox 1 (Pdx1), mRNA. (from RefSeq NM_008814)
46Obox616930.0000001chr7 15,836,459Mus musculus oocyte specific homeobox 6 (Obox6), mRNA. (from RefSeq NM_145710)
47Nkx2-31415160.0000001chr19 43,614,108Mus musculus NK2 homeobox 3 (Nkx2-3), mRNA. (from RefSeq NM_008699)
48Evx24200.0000002chr2 74,657,517Mus musculus even-skipped homeobox 2 (Evx2), mRNA. (from RefSeq NM_007967)
49Dlx21623120.0000001chr2 71,545,081Mus musculus distal-less homeobox 2 (Dlx2), mRNA. (from RefSeq NM_010054)
50Dlx54110.0000002chr6 6,879,945Mus musculus distal-less homeobox 5 (Dlx5), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_010056)