UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Pitx22614e-145chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
2Pitx11572994e-73chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
3Pitx3771315e-66chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
4Alx12721e-23chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
5Alx44402e-21chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
6Pax73593e-21chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
7Alx32571e-20chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
8Arx1419662e-20chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
9Dmbx117218e-20chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
10Pax33531e-19chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
11Prrxl131622e-19chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
12Phox2b1550432e-18chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
13Phox2a1783e-18chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
14Rax1838e-18chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
15Gsc218113e-17chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
16Otx11772e-16chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
17Uncx7403e-16chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
18Vsx11824035e-16chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
19Crx1648006e-16chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
20Otx21819e-16chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
21Gsc1528410.000000000000002chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
22Isx1837360.000000000000001chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
23Pax63620.00000000000001chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
24Shox22530.00000000000001chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
25Prrx12630.00000000000003chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
26Mixl11462120.00000000000008chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
27Vsx22550.0000000000002chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
28Prrx22660.0000000000002chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
29Prop11875550.0000000000003chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
30Nobox1793790.0000000000003chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
31Nkx1-1n/a0.000000000002chr5 33,432,355Mus musculus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. (from RefSeq NM_011320)
32Barhl21851920.000000000003chr5 106,455,344Mus musculus BarH like homeobox 2 (Barhl2), mRNA. (from RefSeq NM_001005477)
33Rhox8n/a0.000000000004chrX 37,876,861Mus musculus reproductive homeobox 8 (Rhox8), mRNA. (from RefSeq NM_001004193)
34Sebox2670.000000000007chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
35Pax43550.00000000001chr6 28,445,843Mus musculus paired box 4 (Pax4), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011038)
36Meox13330.00000000001chr11 101,885,942Mus musculus mesenchyme homeobox 1 (Meox1), mRNA. (from RefSeq NM_010791)
37Hesx14070.00000000002chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
38Gbx21574170.00000000002chr1 89,929,567Mus musculus gastrulation brain homeobox 2 (Gbx2), mRNA. (from RefSeq NM_010262)
39Mnx13360.00000000003chr5 29,475,752Mus musculus motor neuron and pancreas homeobox 1 (Mnx1), mRNA. (from RefSeq NM_019944)
40Gbx11550620.00000000003chr5 24,514,979Mus musculus gastrulation brain homeobox 1 (Gbx1), mRNA. (from RefSeq NM_015739)
41Meox23340.00000000004chr12 37,144,037Mus musculus mesenchyme homeobox 2 (Meox2), mRNA. (from RefSeq NM_008584)
42Barhl13400.00000000005chr2 28,912,045Mus musculus BarH like homeobox 1 (Barhl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_019446)
43Gsx21556660.00000000005chr5 75,076,747Mus musculus GS homeobox 2 (Gsx2), mRNA. (from RefSeq NM_133256)
44Hoxa31863330.00000000007chr6 52,191,088Mus musculus homeobox A3 (Hoxa3), mRNA. (from RefSeq NM_010452)
45Msx23260.00000000009chr13 53,469,979Mus musculus msh homeobox 2 (Msx2), mRNA. (from RefSeq NM_013601)
46Otp2590.00000000009chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
47Nkx1-23460.0000000002chr7 132,597,257Mus musculus NK1 homeobox 2 (Nkx1-2), mRNA. (from RefSeq NM_009123)
48Pdx11406220.0000000002chr5 147,272,903Mus musculus pancreatic and duodenal homeobox 1 (Pdx1), mRNA. (from RefSeq NM_008814)
49Rhox13n/a0.0000000003chrX 38,125,593Mus musculus reproductive homeobox 13 (Rhox13), mRNA. (from RefSeq NM_001185002)
50Hoxb11950.0000000003chr11 96,367,004Mus musculus homeobox B1 (Hoxb1), mRNA. (from RefSeq NM_008266)