UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Uncx7400chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
2Alx44406e-24chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
3Arx1419661e-23chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
4Alx12721e-22chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
5Alx32573e-22chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
6Rax1837e-21chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
7Phox2b1550431e-20chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
8Prrxl131622e-20chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
9Shox22532e-20chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
10Phox2a1784e-20chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
11Vsx11824034e-20chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
12Vsx22557e-20chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
13Pax73592e-19chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
14Pax33534e-19chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
15Dmbx117214e-18chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
16Pax63628e-18chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
17Pitx3771314e-17chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
18Isx1837363e-17chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
19Pitx11572991e-16chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
20Otx11772e-16chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
21Pitx22617e-16chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
22Nobox1793798e-16chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
23Crx1648000.000000000000001chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
24Otx21810.000000000000002chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
25Gsc1528410.000000000000005chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
26Prrx12630.000000000000007chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
27Prrx22660.000000000000007chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
28Otp2590.00000000000001chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
29Prop11875550.00000000000008chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
30Gsc218110.0000000000009chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
31Mixl11462120.0000000000007chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
32Gbx11550620.000000000008chr5 24,514,979Mus musculus gastrulation brain homeobox 1 (Gbx1), mRNA. (from RefSeq NM_015739)
33Nkx1-1n/a0.00000000002chr5 33,432,355Mus musculus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. (from RefSeq NM_011320)
34Nkx6-11455560.00000000002chr5 101,661,567Mus musculus NK6 homeobox 1 (Nkx6-1), mRNA. (from RefSeq NM_144955)
35Nkx1-23460.00000000003chr7 132,597,257Mus musculus NK1 homeobox 2 (Nkx1-2), mRNA. (from RefSeq NM_009123)
36Sebox2670.00000000003chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
37Gbx21574170.00000000003chr1 89,929,567Mus musculus gastrulation brain homeobox 2 (Gbx2), mRNA. (from RefSeq NM_010262)
38Rhox101877220.00000000006chrX 38,069,083Mus musculus reproductive homeobox 10 (Rhox10), mRNA. (from RefSeq NM_001024850)
39Meox23340.0000000002chr12 37,144,037Mus musculus mesenchyme homeobox 2 (Meox2), mRNA. (from RefSeq NM_008584)
40Nkx6-31727800.0000000002chr8 23,156,108Mus musculus NK6 homeobox 3 (Nkx6-3), mRNA. (from RefSeq NM_029002)
41Rhox7bn/a0.0000000002chrX 37,891,835Nucleus (By similarity). (from UniProt A6PW38)
42Hoxb73980.0000000002chr11 96,288,392Mus musculus homeobox B7 (Hoxb7), mRNA. (from RefSeq NM_010460)
43Pdx11406220.0000000003chr5 147,272,903Mus musculus pancreatic and duodenal homeobox 1 (Pdx1), mRNA. (from RefSeq NM_008814)
44Hoxd31800.0000000003chr2 74,730,099Mus musculus homeobox D3 (Hoxd3), mRNA. (from RefSeq NM_010468)
45Pax43550.0000000004chr6 28,445,843Mus musculus paired box 4 (Pax4), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011038)
46Hesx14070.0000000005chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
47Noton/a0.0000000005chr6 85,426,381Mus musculus notochord homeobox (Noto), mRNA. (from RefSeq NM_001007472)
48Hmx31910.0000000007chr7 131,543,896Mus musculus H6 homeobox 3 (Hmx3), mRNA. (from RefSeq NM_008257)
49Meox13330.0000000008chr11 101,885,942Mus musculus mesenchyme homeobox 1 (Meox1), mRNA. (from RefSeq NM_010791)
50Barx23420.0000000009chr9 31,879,753Mus musculus BarH-like homeobox 2 (Barx2), mRNA. (from RefSeq NM_013800)