UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Vsx11824032e-169chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
2Vsx22556e-43chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
3Rax1838e-18chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
4Alx44401e-17chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
5Alx12721e-17chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
6Alx32574e-17chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
7Arx1419668e-17chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
8Pax73591e-16chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
9Pax63621e-16chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
10Pax33532e-16chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
11Phox2b1550432e-16chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
12Phox2a1784e-16chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
13Uncx7400.000000000000002chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
14Crx1648000.000000000000004chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
15Prrxl131620.000000000000007chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
16Dmbx117210.00000000000001chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
17Isx1837360.00000000000004chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
18Prop11875550.0000000000002chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
19Gsc1528410.000000000001chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
20Otp2590.0000000000008chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
21Otx21810.000000000001chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
22Otx11770.000000000002chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
23Shox22530.000000000006chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
24Mixl11462120.00000000002chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
25Gsc218110.00000000004chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
26Sebox2670.00000000009chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
27Pitx11572990.0000000001chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
28Pitx3771310.0000000002chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
29Esx12710.0000000002chrX 137,117,861Mus musculus extraembryonic, spermatogenesis, homeobox 1 (Esx1), mRNA. (from RefSeq NM_007957)
30Pitx22610.0000000003chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
31Prrx12630.000000001chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
32Prrx22660.000000002chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
33Pax43550.000000005chr6 28,445,843Mus musculus paired box 4 (Pax4), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011038)
34Hesx14070.00000001chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
35Duxbl11709950.00000009chr14 25,986,546Mus musculus double homeobox B-like 1 (Duxbl1), mRNA. (from RefSeq NM_183389)
36Duxbl31709950.00000009chr14 26,265,847Mus musculus double homeobox B-like 3 (Duxbl3), mRNA. (from RefSeq NM_001177539)
37Duxbl21709950.00000009chr14 26,126,186Mus musculus double homeobox B-like 2 (Duxbl2), mRNA. (from RefSeq NM_001177538)
38Nobox1793790.0000001chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
39Barhl13400.0000002chr2 28,912,045Mus musculus BarH like homeobox 1 (Barhl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_019446)
40Barhl21851920.0000003chr5 106,455,344Mus musculus BarH like homeobox 2 (Barhl2), mRNA. (from RefSeq NM_001005477)
41Cdx43820.0000004chrX 103,325,995Mus musculus caudal type homeobox 4 (Cdx4), mRNA. (from RefSeq NM_007674)
42Noton/a0.0000003chr6 85,426,381Mus musculus notochord homeobox (Noto), mRNA. (from RefSeq NM_001007472)
43Evx11497540.000001chr6 52,315,938Mus musculus even-skipped homeobox 1 (Evx1), mRNA. (from RefSeq NM_007966)
44Lhx13660.000001chr11 84,521,909Mus musculus LIM homeobox protein 1 (Lhx1), mRNA. (from RefSeq NM_008498)
45Obox516920.000001chr7 15,755,088Mus musculus oocyte specific homeobox 5 (Obox5), mRNA. (from RefSeq NM_145709)
46Dlx54110.000002chr6 6,879,945Mus musculus distal-less homeobox 5 (Dlx5), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_010056)
47Gbx21574170.000003chr1 89,929,567Mus musculus gastrulation brain homeobox 2 (Gbx2), mRNA. (from RefSeq NM_010262)
48Evx24200.000003chr2 74,657,517Mus musculus even-skipped homeobox 2 (Evx2), mRNA. (from RefSeq NM_007967)
49Dlx21623120.000003chr2 71,545,081Mus musculus distal-less homeobox 2 (Dlx2), mRNA. (from RefSeq NM_010054)
50Lhx63640.000004chr2 36,093,612Mus musculus LIM homeobox protein 6 (Lhx6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_008500)