UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Prrx22662e-75chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
2Prrx12631e-50chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
3Phox2b1550434e-18chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
4Phox2a1786e-18chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
5Arx1419668e-18chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
6Prrxl131621e-17chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
7Alx44405e-17chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
8Pax63626e-17chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
9Rax1831e-16chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
10Alx12721e-16chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
11Alx32571e-16chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
12Shox22533e-16chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
13Dmbx117216e-16chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
14Pax33530.000000000000001chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
15Pax73590.000000000000002chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
16Isx1837360.000000000000002chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
17Uncx7400.00000000000003chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
18Otx11770.00000000000006chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
19Prop11875550.00000000000008chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
20Vsx22550.0000000000002chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
21Vsx11824030.0000000000002chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
22Pitx3771310.0000000000004chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
23Gsc1528410.0000000000006chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
24Otx21810.0000000000007chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
25Crx1648000.0000000000009chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
26Pitx22610.000000000001chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
27Otp2590.000000000002chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
28Pitx11572990.000000000002chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
29Rhox8n/a0.00000000002chrX 37,876,861Mus musculus reproductive homeobox 8 (Rhox8), mRNA. (from RefSeq NM_001004193)
30Mixl11462120.00000000002chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
31Nobox1793790.00000000003chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
32Gsc218110.00000000004chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
33Hesx14070.0000000003chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
34Esx12710.000000001chrX 137,117,861Mus musculus extraembryonic, spermatogenesis, homeobox 1 (Esx1), mRNA. (from RefSeq NM_007957)
35Pax43550.0000000009chr6 28,445,843Mus musculus paired box 4 (Pax4), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011038)
36Rhox13n/a0.0000000009chrX 38,125,593Mus musculus reproductive homeobox 13 (Rhox13), mRNA. (from RefSeq NM_001185002)
37Sebox2670.000000002chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
38Rhox101877220.000000002chrX 38,069,083Mus musculus reproductive homeobox 10 (Rhox10), mRNA. (from RefSeq NM_001024850)
39Rhox12n/a0.000000003chrX 38,107,492Mus musculus reproductive homeobox 12 (Rhox12), mRNA. (from RefSeq NM_001025083)
40Rhox7bn/a0.000000004chrX 37,891,835Nucleus (By similarity). (from UniProt A6PW38)
41Rhox111877230.000000005chrX 38,080,867Mus musculus reproductive homeobox 11 (Rhox11), mRNA. (from RefSeq NM_198598)
42Emx11502420.00000001chr6 85,195,898Mus musculus empty spiracles homeobox 1 (Emx1), mRNA. (from RefSeq NM_010131)
43Nkx6-11455560.00000001chr5 101,661,567Mus musculus NK6 homeobox 1 (Nkx6-1), mRNA. (from RefSeq NM_144955)
44Emx24180.00000002chr19 59,461,864Mus musculus empty spiracles homeobox 2 (Emx2), mRNA. (from RefSeq NM_010132)
45Noton/a0.00000002chr6 85,426,381Mus musculus notochord homeobox (Noto), mRNA. (from RefSeq NM_001007472)
46Rhox6n/a0.00000003chrX 37,828,383Mus musculus reproductive homeobox 6 (Rhox6), mRNA. (from RefSeq NM_008955)
47Rhox4an/a0.00000004chrX 37,267,735Mus musculus reproductive homeobox 4A (Rhox4a), mRNA. (from RefSeq NM_001039688)
48Rhox4a2n/a0.00000004chrX 37,393,234Nucleus (By similarity). (from UniProt Q9D3I8)
49Rhox91478530.00000005chrX 37,900,433Mus musculus reproductive homeobox 9 (Rhox9), mRNA. (from RefSeq NM_023894)
50Msx23260.00000006chr13 53,469,979Mus musculus msh homeobox 2 (Msx2), mRNA. (from RefSeq NM_013601)