UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Isx1837368e-129chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
2Arx1419660.0000000000002chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
3Alx44400.0000000000002chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
4Phox2b1550430.0000000000002chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
5Rax1830.0000000000003chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
6Alx32570.0000000000003chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
7Phox2a1780.0000000000006chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
8Alx12720.0000000000007chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
9Pax73590.000000000002chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
10Prrxl131620.000000000002chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
11Pax33530.000000000007chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
12Pax63620.00000000001chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
13Prrx12630.00000000002chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
14Vsx11824030.00000000002chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
15Prrx22660.00000000003chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
16Otx11770.0000000001chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
17Vsx22550.0000000001chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
18Uncx7400.0000000002chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
19Dmbx117210.0000000004chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
20Shox22530.000000001chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
21Pitx3771310.000000004chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
22Otx21810.00000002chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
23Mixl11462120.00000003chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
24Pitx22610.00000003chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
25Gsc1528410.00000003chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
26Pitx11572990.00000006chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
27Crx1648000.00000008chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
28Gsc218110.0000001chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
29Prop11875550.00000009chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
30Gbx21574170.0000004chr1 89,929,567Mus musculus gastrulation brain homeobox 2 (Gbx2), mRNA. (from RefSeq NM_010262)
31Lhx23700.0000007chr2 38,354,240Mus musculus LIM homeobox protein 2 (Lhx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001290646)
32Sebox2670.0000006chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
33Pax43550.000001chr6 28,445,843Mus musculus paired box 4 (Pax4), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011038)
34Otp2590.000002chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
35Hesx14070.000002chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
36Rhox13n/a0.000003chrX 38,125,593Mus musculus reproductive homeobox 13 (Rhox13), mRNA. (from RefSeq NM_001185002)
37Gbx11550620.000006chr5 24,514,979Mus musculus gastrulation brain homeobox 1 (Gbx1), mRNA. (from RefSeq NM_015739)
38Nobox1793790.000007chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
39Cdx21523580.00001chr5 147,304,037Mus musculus caudal type homeobox 2 (Cdx2), mRNA. (from RefSeq NM_007673)
40Dlx21623120.00002chr2 71,545,081Mus musculus distal-less homeobox 2 (Dlx2), mRNA. (from RefSeq NM_010054)
41Nkx1-1n/a0.00002chr5 33,432,355Mus musculus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. (from RefSeq NM_011320)
42Rhox101877220.00002chrX 38,069,083Mus musculus reproductive homeobox 10 (Rhox10), mRNA. (from RefSeq NM_001024850)
43Cdx11425150.00003chr18 61,027,530Mus musculus caudal type homeobox 1 (Cdx1), mRNA. (from RefSeq NM_009880)
44Hoxa31863330.00004chr6 52,191,088Mus musculus homeobox A3 (Hoxa3), mRNA. (from RefSeq NM_010452)
45Hoxb11950.00006chr11 96,367,004Mus musculus homeobox B1 (Hoxb1), mRNA. (from RefSeq NM_008266)
46Noton/a0.00006chr6 85,426,381Mus musculus notochord homeobox (Noto), mRNA. (from RefSeq NM_001007472)
47Rhox7an/a0.00009chrX 37,836,428Mus musculus reproductive homeobox 7A (Rhox7a), mRNA. (from RefSeq NM_001025086)
48Rhox7bn/a0.0001chrX 37,891,835Nucleus (By similarity). (from UniProt A6PW38)
49Hoxd31800.0001chr2 74,730,099Mus musculus homeobox D3 (Hoxd3), mRNA. (from RefSeq NM_010468)
50Esx12710.0002chrX 137,117,861Mus musculus extraembryonic, spermatogenesis, homeobox 1 (Esx1), mRNA. (from RefSeq NM_007957)