UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Shox22532e-132chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
2Arx1419665e-21chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
3Uncx7406e-21chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
4Prrxl131622e-20chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
5Pax33533e-20chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
6Pax73594e-20chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
7Phox2b1550436e-20chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
8Phox2a1782e-19chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
9Rax1834e-19chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
10Alx32575e-19chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
11Alx44401e-18chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
12Alx12728e-18chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
13Otx11771e-17chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
14Isx1837362e-17chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
15Dmbx117214e-17chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
16Prrx22664e-17chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
17Otx21811e-16chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
18Crx1648003e-16chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
19Prrx12634e-16chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
20Pitx3771316e-16chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
21Otp2590.000000000000001chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
22Pitx11572990.000000000000001chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
23Pax63620.000000000000001chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
24Vsx11824030.000000000000002chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
25Pitx22610.00000000000001chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
26Prop11875550.00000000000002chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
27Nobox1793790.0000000000002chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
28Gsc1528410.0000000000005chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
29Vsx22550.0000000000005chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
30Mixl11462120.0000000000005chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
31Sebox2670.000000000008chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
32Gsc218110.00000000002chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
33Rhox8n/a0.00000000006chrX 37,876,861Mus musculus reproductive homeobox 8 (Rhox8), mRNA. (from RefSeq NM_001004193)
34Esx12710.0000000001chrX 137,117,861Mus musculus extraembryonic, spermatogenesis, homeobox 1 (Esx1), mRNA. (from RefSeq NM_007957)
35Rhox12n/a0.0000000005chrX 38,107,492Mus musculus reproductive homeobox 12 (Rhox12), mRNA. (from RefSeq NM_001025083)
36Lbx11776100.000000001chr19 45,234,248Mus musculus ladybird homeobox 1 (Lbx1), mRNA. (from RefSeq NM_010691)
37Nkx1-1n/a0.000000001chr5 33,432,355Mus musculus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. (from RefSeq NM_011320)
38Hesx14070.000000001chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
39Nkx1-23460.000000002chr7 132,597,257Mus musculus NK1 homeobox 2 (Nkx1-2), mRNA. (from RefSeq NM_009123)
40Noton/a0.000000002chr6 85,426,381Mus musculus notochord homeobox (Noto), mRNA. (from RefSeq NM_001007472)
41Emx11502420.000000004chr6 85,195,898Mus musculus empty spiracles homeobox 1 (Emx1), mRNA. (from RefSeq NM_010131)
42Msx13280.000000004chr5 37,822,534Mus musculus msh homeobox 1 (Msx1), mRNA. (from RefSeq NM_010835)
43Msx23260.000000005chr13 53,469,979Mus musculus msh homeobox 2 (Msx2), mRNA. (from RefSeq NM_013601)
44Rhox13n/a0.000000005chrX 38,125,593Mus musculus reproductive homeobox 13 (Rhox13), mRNA. (from RefSeq NM_001185002)
45Rhox4b18060.000000006chrX 37,434,886Mus musculus reproductive homeobox 4B (Rhox4b), mRNA. (from RefSeq NM_021300)
46Rhox4gn/a0.000000005chrX 37,648,913Mus musculus reproductive homeobox 4G (Rhox4g), mRNA. (from RefSeq NM_001039698)
47Rhox4fn/a0.000000005chrX 37,605,299Mus musculus reproductive homeobox 4F (Rhox4f), mRNA. (from RefSeq NM_001039696)
48Rhox4an/a0.000000006chrX 37,267,735Mus musculus reproductive homeobox 4A (Rhox4a), mRNA. (from RefSeq NM_001039688)
49Rhox4a2n/a0.000000006chrX 37,393,234Nucleus (By similarity). (from UniProt Q9D3I8)
50Msx37430.000000007chr7 140,047,731Mus musculus msh homeobox 3 (Msx3), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_010836)