UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Gsc1528412e-123chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
2Gsc218111e-22chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
3Prrxl131622e-18chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
4Phox2b1550438e-18chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
5Alx12729e-18chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
6Phox2a1782e-17chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
7Alx44402e-17chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
8Vsx11824033e-17chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
9Arx1419665e-17chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
10Alx32571e-16chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
11Pax33531e-16chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
12Pax63621e-16chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
13Pax73591e-16chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
14Crx1648002e-16chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
15Otx11773e-16chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
16Dmbx117213e-16chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
17Rax1835e-16chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
18Pitx3771319e-16chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
19Uncx7409e-16chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
20Pitx22610.000000000000001chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
21Isx1837360.000000000000001chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
22Otx21810.000000000000003chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
23Pitx11572990.000000000000005chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
24Vsx22550.00000000000003chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
25Prrx22660.00000000000005chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
26Hesx14070.00000000000005chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
27Prrx12630.0000000000001chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
28Shox22530.0000000000005chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
29Mixl11462120.0000000000007chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
30Pax43550.000000000001chr6 28,445,843Mus musculus paired box 4 (Pax4), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011038)
31Nobox1793790.000000000001chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
32Prop11875550.000000000001chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
33Nkx1-23460.000000000002chr7 132,597,257Mus musculus NK1 homeobox 2 (Nkx1-2), mRNA. (from RefSeq NM_009123)
34Nkx1-1n/a0.000000000005chr5 33,432,355Mus musculus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. (from RefSeq NM_011320)
35Sebox2670.00000000001chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
36Gbx21574170.0000000001chr1 89,929,567Mus musculus gastrulation brain homeobox 2 (Gbx2), mRNA. (from RefSeq NM_010262)
37Dbx21838000.0000000001chr15 95,639,761Mus musculus developing brain homeobox 2 (Dbx2), mRNA. (from RefSeq NM_207533)
38Dbx11532620.0000000001chr7 49,634,174Mus musculus developing brain homeobox 1 (Dbx1), mRNA. (from RefSeq NM_001005232)
39Mnx13360.0000000002chr5 29,475,752Mus musculus motor neuron and pancreas homeobox 1 (Mnx1), mRNA. (from RefSeq NM_019944)
40Nkx6-31727800.0000000002chr8 23,156,108Mus musculus NK6 homeobox 3 (Nkx6-3), mRNA. (from RefSeq NM_029002)
41Gbx11550620.0000000002chr5 24,514,979Mus musculus gastrulation brain homeobox 1 (Gbx1), mRNA. (from RefSeq NM_015739)
42Barhl13400.0000000003chr2 28,912,045Mus musculus BarH like homeobox 1 (Barhl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_019446)
43Barhl21851920.0000000006chr5 106,455,344Mus musculus BarH like homeobox 2 (Barhl2), mRNA. (from RefSeq NM_001005477)
44Rhox13n/a0.0000000006chrX 38,125,593Mus musculus reproductive homeobox 13 (Rhox13), mRNA. (from RefSeq NM_001185002)
45Emx24180.0000000007chr19 59,461,864Mus musculus empty spiracles homeobox 2 (Emx2), mRNA. (from RefSeq NM_010132)
46Rhox12n/a0.0000000006chrX 38,107,492Mus musculus reproductive homeobox 12 (Rhox12), mRNA. (from RefSeq NM_001025083)
47Otp2590.000000001chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
48Bsx1845180.000000002chr9 40,877,092Mus musculus brain specific homeobox (Bsx), mRNA. (from RefSeq NM_178245)
49Hlx1575290.000000002chr1 184,729,879Mus musculus H2.0-like homeobox (Hlx), mRNA. (from RefSeq NM_008250)
50Hmx31910.000000004chr7 131,543,896Mus musculus H6 homeobox 3 (Hmx3), mRNA. (from RefSeq NM_008257)