UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Alx32579e-150chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
2Alx12724e-49chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
3Alx44403e-43chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
4Arx1419663e-21chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
5Phox2b1550435e-19chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
6Uncx7401e-18chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
7Prrxl131622e-18chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
8Phox2a1782e-18chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
9Vsx22553e-18chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
10Pax73591e-17chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
11Vsx11824032e-17chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
12Pitx22614e-17chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
13Pax33537e-17chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
14Prrx12631e-16chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
15Rax1833e-16chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
16Isx1837363e-16chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
17Prrx22662e-16chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
18Pitx3771314e-16chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
19Pax63623e-16chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
20Dmbx117215e-16chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
21Pitx11572990.000000000000006chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
22Shox22530.0000000000001chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
23Crx1648000.0000000000001chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
24Gsc1528410.0000000000006chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
25Nobox1793790.0000000000007chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
26Prop11875550.0000000000007chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
27Otx11770.0000000000008chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
28Otp2590.000000000003chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
29Otx21810.00000000001chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
30Gsc218110.00000000004chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
31Mixl11462120.0000000001chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
32Pax43550.0000000004chr6 28,445,843Mus musculus paired box 4 (Pax4), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011038)
33Sebox2670.0000000007chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
34Rhox8n/a0.000000003chrX 37,876,861Mus musculus reproductive homeobox 8 (Rhox8), mRNA. (from RefSeq NM_001004193)
35Rhox7bn/a0.000000003chrX 37,891,835Nucleus (By similarity). (from UniProt A6PW38)
36Hesx14070.000000005chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
37Noton/a0.000000008chr6 85,426,381Mus musculus notochord homeobox (Noto), mRNA. (from RefSeq NM_001007472)
38Rhox13n/a0.000000008chrX 38,125,593Mus musculus reproductive homeobox 13 (Rhox13), mRNA. (from RefSeq NM_001185002)
39Nkx1-1n/a0.00000002chr5 33,432,355Mus musculus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. (from RefSeq NM_011320)
40Nkx1-23460.00000005chr7 132,597,257Mus musculus NK1 homeobox 2 (Nkx1-2), mRNA. (from RefSeq NM_009123)
41Rhox101877220.00000004chrX 38,069,083Mus musculus reproductive homeobox 10 (Rhox10), mRNA. (from RefSeq NM_001024850)
42Nkx6-24050.00000006chr7 139,582,005Mus musculus NK6 homeobox 2 (Nkx6-2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_183248)
43Esx12710.00000009chrX 137,117,861Mus musculus extraembryonic, spermatogenesis, homeobox 1 (Esx1), mRNA. (from RefSeq NM_007957)
44Rhox12n/a0.00000007chrX 38,107,492Mus musculus reproductive homeobox 12 (Rhox12), mRNA. (from RefSeq NM_001025083)
45Rhox7an/a0.00000008chrX 37,836,428Mus musculus reproductive homeobox 7A (Rhox7a), mRNA. (from RefSeq NM_001025086)
46Hoxb11950.00000009chr11 96,367,004Mus musculus homeobox B1 (Hoxb1), mRNA. (from RefSeq NM_008266)
47Nkx6-11455560.0000001chr5 101,661,567Mus musculus NK6 homeobox 1 (Nkx6-1), mRNA. (from RefSeq NM_144955)
48Nkx6-31727800.0000002chr8 23,156,108Mus musculus NK6 homeobox 3 (Nkx6-3), mRNA. (from RefSeq NM_029002)
49Barhl21851920.0000002chr5 106,455,344Mus musculus BarH like homeobox 2 (Barhl2), mRNA. (from RefSeq NM_001005477)
50Hoxd11421370.0000002chr2 74,764,061Mus musculus homeobox D1 (Hoxd1), mRNA. (from RefSeq NM_010467)