UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Phox2b1550433e-85chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
2Phox2a1782e-56chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
3Arx1419662e-21chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
4Prrxl131625e-20chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
5Alx44402e-19chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
6Crx1648002e-19chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
7Pax33534e-19chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
8Alx32577e-19chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
9Pax73599e-19chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
10Alx12722e-18chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
11Rax1837e-18chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
12Otp2592e-17chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
13Uncx7402e-17chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
14Otx21815e-17chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
15Otx11771e-16chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
16Isx1837361e-16chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
17Shox22533e-16chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
18Vsx11824032e-16chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
19Pax63620.000000000000008chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
20Dmbx117210.00000000000001chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
21Prrx22660.00000000000001chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
22Pitx3771310.00000000000002chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
23Prrx12630.00000000000002chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
24Pitx22610.00000000000007chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
25Pitx11572990.0000000000002chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
26Gsc1528410.0000000000003chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
27Vsx22550.0000000000007chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
28Sebox2670.000000000001chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
29Gsc218110.000000000005chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
30Mixl11462120.000000000005chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
31Prop11875550.000000000009chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
32Esx12710.00000000007chrX 137,117,861Mus musculus extraembryonic, spermatogenesis, homeobox 1 (Esx1), mRNA. (from RefSeq NM_007957)
33Noton/a0.0000000005chr6 85,426,381Mus musculus notochord homeobox (Noto), mRNA. (from RefSeq NM_001007472)
34Nobox1793790.000000001chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
35Hesx14070.000000007chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
36Meox23340.00000003chr12 37,144,037Mus musculus mesenchyme homeobox 2 (Meox2), mRNA. (from RefSeq NM_008584)
37Emx11502420.00000006chr6 85,195,898Mus musculus empty spiracles homeobox 1 (Emx1), mRNA. (from RefSeq NM_010131)
38Meox13330.00000007chr11 101,885,942Mus musculus mesenchyme homeobox 1 (Meox1), mRNA. (from RefSeq NM_010791)
39Emx24180.00000007chr19 59,461,864Mus musculus empty spiracles homeobox 2 (Emx2), mRNA. (from RefSeq NM_010132)
40Gsx13250.00000007chr5 147,189,821Mus musculus GS homeobox 1 (Gsx1), mRNA. (from RefSeq NM_008178)
41Rhox7bn/a0.00000006chrX 37,891,835Nucleus (By similarity). (from UniProt A6PW38)
42Msx13280.0000001chr5 37,822,534Mus musculus msh homeobox 1 (Msx1), mRNA. (from RefSeq NM_010835)
43Nkx1-1n/a0.0000001chr5 33,432,355Mus musculus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. (from RefSeq NM_011320)
44Msx23260.0000002chr13 53,469,979Mus musculus msh homeobox 2 (Msx2), mRNA. (from RefSeq NM_013601)
45Msx37430.0000002chr7 140,047,731Mus musculus msh homeobox 3 (Msx3), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_010836)
46Dlx11623100.0000001chr2 71,531,046Mus musculus distal-less homeobox 1 (Dlx1), mRNA. (from RefSeq NM_010053)
47Rhox8n/a0.0000001chrX 37,876,861Mus musculus reproductive homeobox 8 (Rhox8), mRNA. (from RefSeq NM_001004193)
48Gsx21556660.0000002chr5 75,076,747Mus musculus GS homeobox 2 (Gsx2), mRNA. (from RefSeq NM_133256)
49Barhl13400.0000004chr2 28,912,045Mus musculus BarH like homeobox 1 (Barhl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_019446)
50Dlx54110.0000004chr6 6,879,945Mus musculus distal-less homeobox 5 (Dlx5), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_010056)