UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Phox2a1786e-99chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
2Phox2b1550431e-57chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
3Arx1419668e-25chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
4Prrxl131625e-24chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
5Alx44401e-23chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
6Alx12723e-23chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
7Alx32576e-23chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
8Pax33533e-22chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
9Rax1831e-21chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
10Pax73598e-22chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
11Crx1648001e-20chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
12Uncx7401e-20chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
13Isx1837361e-20chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
14Vsx11824035e-20chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
15Otx11771e-19chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
16Shox22532e-19chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
17Prrx12634e-19chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
18Dmbx117214e-19chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
19Prrx22664e-19chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
20Otx21817e-19chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
21Pitx3771311e-18chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
22Pax63622e-18chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
23Pitx22616e-18chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
24Pitx11572992e-17chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
25Vsx22557e-17chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
26Otp2591e-16chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
27Gsc1528413e-16chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
28Prop11875557e-16chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
29Gsc218110.000000000000004chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
30Mixl11462120.00000000000001chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
31Sebox2670.00000000000002chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
32Nobox1793790.0000000000002chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
33Noton/a0.000000000001chr6 85,426,381Mus musculus notochord homeobox (Noto), mRNA. (from RefSeq NM_001007472)
34Msx23260.000000000009chr13 53,469,979Mus musculus msh homeobox 2 (Msx2), mRNA. (from RefSeq NM_013601)
35Hesx14070.00000000001chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
36Emx24180.00000000002chr19 59,461,864Mus musculus empty spiracles homeobox 2 (Emx2), mRNA. (from RefSeq NM_010132)
37Nkx1-1n/a0.00000000006chr5 33,432,355Mus musculus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. (from RefSeq NM_011320)
38Emx11502420.00000000006chr6 85,195,898Mus musculus empty spiracles homeobox 1 (Emx1), mRNA. (from RefSeq NM_010131)
39Rhox8n/a0.00000000005chrX 37,876,861Mus musculus reproductive homeobox 8 (Rhox8), mRNA. (from RefSeq NM_001004193)
40Rhox7bn/a0.00000000006chrX 37,891,835Nucleus (By similarity). (from UniProt A6PW38)
41Gsx21556660.0000000001chr5 75,076,747Mus musculus GS homeobox 2 (Gsx2), mRNA. (from RefSeq NM_133256)
42Nkx1-23460.0000000002chr7 132,597,257Mus musculus NK1 homeobox 2 (Nkx1-2), mRNA. (from RefSeq NM_009123)
43Gsx13250.0000000002chr5 147,189,821Mus musculus GS homeobox 1 (Gsx1), mRNA. (from RefSeq NM_008178)
44Dlx11623100.0000000002chr2 71,531,046Mus musculus distal-less homeobox 1 (Dlx1), mRNA. (from RefSeq NM_010053)
45Esx12710.0000000004chrX 137,117,861Mus musculus extraembryonic, spermatogenesis, homeobox 1 (Esx1), mRNA. (from RefSeq NM_007957)
46Rhox13n/a0.0000000003chrX 38,125,593Mus musculus reproductive homeobox 13 (Rhox13), mRNA. (from RefSeq NM_001185002)
47Dlx21623120.0000000004chr2 71,545,081Mus musculus distal-less homeobox 2 (Dlx2), mRNA. (from RefSeq NM_010054)
48Meox23340.0000000004chr12 37,144,037Mus musculus mesenchyme homeobox 2 (Meox2), mRNA. (from RefSeq NM_008584)
49Msx13280.0000000005chr5 37,822,534Mus musculus msh homeobox 1 (Msx1), mRNA. (from RefSeq NM_010835)
50Barhl13400.0000000007chr2 28,912,045Mus musculus BarH like homeobox 1 (Barhl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_019446)