UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Otx11772e-116chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
2Otx21812e-50chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
3Crx1648003e-36chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
4Prrxl131623e-20chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
5Phox2b1550431e-19chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
6Phox2a1783e-19chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
7Dmbx117213e-19chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
8Arx1419661e-18chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
9Pitx11572992e-17chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
10Rax1832e-17chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
11Shox22532e-17chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
12Isx1837365e-17chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
13Alx12727e-17chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
14Alx44408e-17chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
15Alx32572e-16chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
16Pax63622e-16chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
17Pax73592e-16chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
18Pitx3771312e-16chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
19Uncx7402e-16chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
20Pax33533e-16chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
21Mixl11462129e-16chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
22Pitx22618e-16chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
23Gsc1528410.000000000000001chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
24Vsx11824030.000000000000002chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
25Gsc218110.000000000000006chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
26Prrx22660.000000000000009chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
27Otp2590.00000000000003chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
28Prrx12630.00000000000004chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
29Prop11875550.00000000000009chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
30Vsx22550.000000000004chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
31Sebox2670.00000000001chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
32Hesx14070.00000000002chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
33Duxbl11709950.00000000008chr14 25,986,546Mus musculus double homeobox B-like 1 (Duxbl1), mRNA. (from RefSeq NM_183389)
34Duxbl31709950.00000000008chr14 26,265,847Mus musculus double homeobox B-like 3 (Duxbl3), mRNA. (from RefSeq NM_001177539)
35Duxbl21709950.00000000008chr14 26,126,186Mus musculus double homeobox B-like 2 (Duxbl2), mRNA. (from RefSeq NM_001177538)
36Esx12710.0000000003chrX 137,117,861Mus musculus extraembryonic, spermatogenesis, homeobox 1 (Esx1), mRNA. (from RefSeq NM_007957)
37Rhox12n/a0.0000000009chrX 38,107,492Mus musculus reproductive homeobox 12 (Rhox12), mRNA. (from RefSeq NM_001025083)
38Pax43550.000000002chr6 28,445,843Mus musculus paired box 4 (Pax4), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011038)
39Nkx1-23460.000000001chr7 132,597,257Mus musculus NK1 homeobox 2 (Nkx1-2), mRNA. (from RefSeq NM_009123)
40Meox13330.000000002chr11 101,885,942Mus musculus mesenchyme homeobox 1 (Meox1), mRNA. (from RefSeq NM_010791)
41Nkx1-1n/a0.000000003chr5 33,432,355Mus musculus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. (from RefSeq NM_011320)
42Meox23340.000000003chr12 37,144,037Mus musculus mesenchyme homeobox 2 (Meox2), mRNA. (from RefSeq NM_008584)
43Rhox13n/a0.000000004chrX 38,125,593Mus musculus reproductive homeobox 13 (Rhox13), mRNA. (from RefSeq NM_001185002)
44Msx23260.00000001chr13 53,469,979Mus musculus msh homeobox 2 (Msx2), mRNA. (from RefSeq NM_013601)
45Evx11497540.00000002chr6 52,315,938Mus musculus even-skipped homeobox 1 (Evx1), mRNA. (from RefSeq NM_007966)
46Evx24200.00000004chr2 74,657,517Mus musculus even-skipped homeobox 2 (Evx2), mRNA. (from RefSeq NM_007967)
47Dlx21623120.00000003chr2 71,545,081Mus musculus distal-less homeobox 2 (Dlx2), mRNA. (from RefSeq NM_010054)
48Pdx11406220.00000004chr5 147,272,903Mus musculus pancreatic and duodenal homeobox 1 (Pdx1), mRNA. (from RefSeq NM_008814)
49Nkx2-31415160.00000004chr19 43,614,108Mus musculus NK2 homeobox 3 (Nkx2-3), mRNA. (from RefSeq NM_008699)
50Emx24180.00000005chr19 59,461,864Mus musculus empty spiracles homeobox 2 (Emx2), mRNA. (from RefSeq NM_010132)