UCSC Mouse Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Sebox2673e-108chr11 78,504,264Mus musculus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. (from RefSeq NM_008759)
2Phox2b1550430.000000000000003chr5 67,096,850Mus musculus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. (from RefSeq NM_008888)
3Alx44400.000000000000004chr2 93,661,861Mus musculus aristaless-like homeobox 4 (Alx4), mRNA. (from RefSeq NM_007442)
4Rax1830.000000000000007chr18 65,936,862Mus musculus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. (from RefSeq NM_013833)
5Phox2a1780.000000000000008chr7 101,820,519Mus musculus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. (from RefSeq NM_008887)
6Mixl11462120.000000000000008chr1 180,695,038Mus musculus Mix1 homeobox-like 1 (Xenopus laevis) (Mixl1), mRNA. (from RefSeq NM_013729)
7Prrxl131620.00000000000001chr14 32,615,188Mus musculus paired related homeobox protein-like 1 (Prrxl1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001347590)
8Alx32570.00000000000003chr3 107,600,403Mus musculus aristaless-like homeobox 3 (Alx3), mRNA. (from RefSeq NM_007441)
9Arx1419660.00000000000003chrX 93,292,426Mus musculus aristaless related homeobox (Arx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007492)
10Alx12720.00000000000004chr10 103,019,539Transcriptional activator that acts at a palindromic  recognition sequence to enhance the activity of the SV40 and TK  promoters. May play a role in chondrocyte differentiation and may  also influence cervix development (By similarity). (from UniProt Q8C8B0)
11Pax73590.0000000000001chr4 139,785,295Mus musculus paired box 7 (Pax7), mRNA. (from RefSeq NM_011039)
12Pax33530.0000000000001chr1 78,149,052Mus musculus paired box 3 (Pax3), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001159520)
13Isx1837360.0000000000001chr8 74,883,339Mus musculus intestine specific homeobox (Isx), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_027837)
14Vsx11824030.0000000000002chr2 150,685,031Mus musculus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. (from RefSeq NM_054068)
15Crx1648000.0000000000002chr7 15,872,957Mus musculus cone-rod homeobox (Crx), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_007770)
16Dmbx117210.0000000000003chr4 115,927,522Mus musculus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_001025567)
17Prop11875550.0000000000004chr11 50,952,285Mus musculus paired like homeodomain factor 1 (Prop1), mRNA. (from RefSeq NM_008936)
18Otx21810.000000000001chr14 48,665,835Nucleus (By similarity). (from UniProt Q8VD35)
19Otx11770.000000000002chr11 21,998,189Mus musculus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. (from RefSeq NM_011023)
20Shox22530.000000000002chr3 66,976,776Mus musculus short stature homeobox 2 (Shox2), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_013665)
21Pitx3771310.000000000004chr19 46,142,005Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 3 (Pitx3), mRNA. (from RefSeq NM_008852)
22Pitx22610.000000000004chr3 129,209,734Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_011098)
23Gsc1528410.000000000008chr12 104,472,269Mus musculus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. (from RefSeq NM_010351)
24Uncx7400.000000000007chr5 139,545,836Mus musculus UNC homeobox (Uncx), mRNA. (from RefSeq NM_013702)
25Vsx22550.00000000003chr12 84,582,609Mus musculus visual system homeobox 2 (Vsx2), transcript variant 2, mRNA. (from RefSeq NM_007701)
26Pitx11572990.00000000003chr13 55,828,238Mus musculus paired-like homeodomain transcription factor 1 (Pitx1), mRNA. (from RefSeq NM_011097)
27Prrx12630.00000000003chr1 163,279,414Mus musculus paired related homeobox 1 (Prrx1), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011127)
28Prrx22660.00000000004chr2 30,863,155Mus musculus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. (from RefSeq NM_009116)
29Pax63620.00000000005chr2 105,683,132Mus musculus paired box 6 (Pax6), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001244198)
30Gbx21574170.00000000005chr1 89,929,567Mus musculus gastrulation brain homeobox 2 (Gbx2), mRNA. (from RefSeq NM_010262)
31Hesx14070.0000000001chr14 26,998,370Required for the normal development of the forebrain,  eyes and other anterior structures such as the olfactory placodes  and pituitary gland. Possible transcriptional repressor. Binds to  the palindromic PIII sequence, 5'-AGCTTGAGTCTAATTGAATTAACTGTAC-3'.  HESX1 and PROP1 bind as heterodimers on this palindromic site,  and, in vitro, HESX1 can antagonize PROP1 activation. (from UniProt Q61658)
32Gsc218110.0000000001chr16 17,914,306Mus musculus goosecoid homebox 2 (Gsc2), mRNA. (from RefSeq NM_029469)
33Pax43550.0000000004chr6 28,445,843Mus musculus paired box 4 (Pax4), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_011038)
34Nkx2-14300.000000001chr12 56,534,433Mus musculus NK2 homeobox 1 (Nkx2-1), mRNA. (from RefSeq NM_009385)
35Nkx2-41517990.000000001chr2 147,084,380Mus musculus NK2 homeobox 4 (Nkx2-4), mRNA. (from RefSeq NM_023504)
36Gbx11550620.0000000009chr5 24,514,979Mus musculus gastrulation brain homeobox 1 (Gbx1), mRNA. (from RefSeq NM_015739)
37Lbx216880.000000002chr6 83,087,305Mus musculus ladybird homeobox 2 (Lbx2), mRNA. (from RefSeq NM_010692)
38Otp2590.000000002chr13 94,880,366Mus musculus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. (from RefSeq NM_011021)
39Lhx13660.000000003chr11 84,521,909Mus musculus LIM homeobox protein 1 (Lhx1), mRNA. (from RefSeq NM_008498)
40Hoxb31850.000000006chr11 96,335,628Mus musculus homeobox B3 (Hoxb3), transcript variant 1, mRNA. (from RefSeq NM_001079869)
41Hoxb133890.000000006chr11 96,195,881Mus musculus homeobox B13 (Hoxb13), mRNA. (from RefSeq NM_008267)
42Noton/a0.000000007chr6 85,426,381Mus musculus notochord homeobox (Noto), mRNA. (from RefSeq NM_001007472)
43Lhx53680.00000001chr5 120,436,461Mus musculus LIM homeobox protein 5 (Lhx5), mRNA. (from RefSeq NM_008499)
44Hoxa31863330.00000001chr6 52,191,088Mus musculus homeobox A3 (Hoxa3), mRNA. (from RefSeq NM_010452)
45Nkx1-1n/a0.00000001chr5 33,432,355Mus musculus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. (from RefSeq NM_011320)
46Nkx3-11890.00000002chr14 69,192,650Mus musculus NK3 homeobox 1 (Nkx3-1), mRNA. (from RefSeq NM_010921)
47Nobox1793790.00000002chr6 43,306,614Mus musculus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. (from RefSeq NM_130869)
48Duxbl11709950.00000002chr14 25,986,546Mus musculus double homeobox B-like 1 (Duxbl1), mRNA. (from RefSeq NM_183389)
49Duxbl31709950.00000002chr14 26,265,847Mus musculus double homeobox B-like 3 (Duxbl3), mRNA. (from RefSeq NM_001177539)
50Duxbl21709950.00000002chr14 26,126,186Mus musculus double homeobox B-like 2 (Duxbl2), mRNA. (from RefSeq NM_001177538)