UCSC Rat Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
RGD Gene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Ccdc45RGD:1309655
    
    
     
0chr10 96,154,105n/a
2Clk3RGD:621259
    
    
     
n/achr8 61,526,006has autophosphorylation activity; may play a role in testicular function
3Phkg2RGD:620024
    
    
     
n/achr1 186,864,339phosphorylase kinase catalytic subunit isoform; catalyzes the phosphorylation and activation of glycogen phosphorylase
4Arhgap1RGD:1306068
    
    
     
n/achr3 76,041,771n/a
5Stx8RGD:61917
    
    
     
n/achr10 54,821,299essential for intracellular membrane fusion
6Arhgef7RGD:620624
    
    
     
n/achr16 82,562,281Rac/Cdc42-specific guanine nucleotide exchange factor; mediates bFGF-induced neurite outgrowth
7SordRGD:3734
    
    
     
n/achr3 109,032,638catalyzes the conversion of L-iditol and NAD+ to L-sorbose and NADH in the polyol pathway; acts as a tetramer with one zinc atom per subunit
8Sart1RGD:61930
    
    
     
n/achr1 208,030,950gene expressed in the nucleus and upregulated in proliferating cells, also found in cytoplasm of epithelial cancer cells
9Atp5slRGD:1549698
    
    
     
n/achr1 80,830,802n/a
10Rad52RGD:1304975
    
    
     
n/achr4 156,288,605n/a
11Sfrs5RGD:3664
    
    
     
n/achr6 104,730,634may act as a regulator of alternative pre-mRNA splicing; may play a role in cell cycle regulation
12Akap8RGD:620832
    
    
     
n/achr7 12,881,318scaffolding protein that is involved in targeting type II cAMP-dependent protein kinase for cAMP-responsive nuclear events
13Tpp2RGD:621584
    
    
     
n/achr9 43,025,514extralysosomal enzyme involved in degrading peptides generated by the proteasome
14Lemd2RGD:1305341
    
    
     
n/achr20 5,431,272n/a
15Ccndbp1RGD:1304669
    
    
     
n/achr3 107,794,086n/a
16Rasa1RGD:3537
    
    
     
n/achr2 14,245,819may play a role in Ras GTPase mediated signal transduction; may be involved in cell proliferation and cell migration
17Stx4RGD:621019
    
    
     
n/achr1 187,129,389involved in docking of synaptic vesicles at presynaptic active zones
18SsbRGD:620804
    
    
     
n/achr3 52,005,858involved in tRNA processing and nuclear export
19PhaxRGD:708448
    
    
     
n/achr18 52,353,173resiniferatoxin-binding protein; may have a role in neuronal function
20Arih2RGD:1305839
    
    
     
n/achr8 113,676,461n/a
21Nxf1RGD:62014
    
    
     
n/achr1 211,435,201involved in nuclear export of RNA transcripts; associates with NXT1
22PpoxRGD:1310543
    
    
     
n/achr13 87,172,671n/a
23GaltRGD:1306483
    
    
     
n/achr5 59,187,030enzyme in the galactose metabolism pathway; catalyzes the conversion of UDP-glucose + galactose-1-phosphate to glucose-1-phosphate + UDP-galactose
24MGC72560RGD:735078
    
    
     
n/achr1 159,370,256n/a
25Rfc1RGD:620619
    
    
     
n/achr14 45,703,554transcriptional repressor that regulates transcription of the vasoactive intestinal peptide receptor gene
26Mtrf1lRGD:1598312
    
    
     
n/achr1 36,511,773n/a
27VarsRGD:3950
    
    
     
n/achr20 3,881,708catalyze the aminoacylation of tRNA by valine
28Znf775RGD:1304910
    
    
     
n/achr4 76,708,737n/a
29Cdk7RGD:621124
    
    
     
n/achr2 31,513,109a cyclin-dependent protein kinase putatively involved with cell cycle and meiosis
30P2rx4RGD:62073
    
    
     
n/achr12 34,952,725ATP-activated ionotropic receptor; involved in synaptic transmission in the central nervous system
31BckdhaRGD:2196
    
    
     
n/achr1 80,852,289plays a role in the conversion of 3-methyl-2-oxobutanoate and lipoamide to S-(2-methylpropanoyl)dihydrolipoamide and CO2
32Sfrs3RGD:1309233
    
    
     
n/achr20 7,321,614n/a
33Ppp5cRGD:68415
    
    
     
n/achr1 77,357,305may act as a phosphatase to deactivate the atrial natriuretic peptide receptor/guanylyl cyclase; mouse homolog binds the ANP-receptor kinase-like domain
34Nmt1RGD:628642
    
    
     
n/achr10 92,213,605catalyzes the transfer of a myristol group to an amino-terminal glycine residue; may play a role in response to cardiac injury
35Tmem205RGD:1563250
    
    
     
n/achr8 21,027,100n/a
36Chmp1aRGD:1311083
    
    
     
n/achr19 53,526,121n/a
37Cox8aRGD:620638
    
    
     
n/achr1 209,887,301subunit of the cytochrome c oxidase enzyme which acts in the mitochondrial respiratory chain
38Ssrp1RGD:621143
    
    
     
n/achr3 68,277,771DNA binding protein
39Amd1RGD:2104
    
    
     
n/achr20 44,460,293ubiquitous enzyme found in nearly all mammalian cells; may be involved with cell growth
40RGD1307254RGD:1307254
    
    
     
n/achr15 57,019,214n/a
41RGD1309188RGD:1309188
    
    
     
n/achr8 20,699,950n/a
42Smn1RGD:620755
    
    
     
n/achr2 31,153,840plays a role in spliceosome assembly; may be involved in neuronal functions mediated by synaptic activity
43Tceb1RGD:620658
    
    
     
n/achr5 1,964,04815 kDa subunit of the transcription factor B (SIII) complex, also known as elongin C; releases RNA polymerase II from transient pausing at arresting sites
44Ddit3RGD:62391
    
    
     
n/achr7 67,250,160plays a role in the ER stress response
45Nup98RGD:71033
    
    
     
n/achr1 159,647,384nuclear pore complex protein; involved in nuclear pore complex docking and transport
46Pggt1bRGD:621754
    
    
     
n/achr18 40,431,469a complex-forming transferase involved in amino acid geranylgeranylation of proteins containing a carboxyl-terminal CAAX motif, regulation of the cell cycle and nitric oxide synthase 2 biosynthesis
47Tmem218RGD:1311364
    
    
     
n/achr8 38,466,964n/a
48Bnip3lRGD:621354
    
    
     
n/achr15 46,528,191may be involved in oligodendroglial lineage cell differentiation; may be involved in apoptosis
49PdhxRGD:1566332
    
    
     
n/achr3 88,255,582n/a
50Prim2RGD:631433
    
    
     
n/achr9 32,315,622may play a role in DNA replication; V288M mutation is detected in a hepatoma cell line