UCSC Rat Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
RGD Gene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1Tuba1bRGD:1565476
    
    
     
0chr7 137,708,348n/a
2LOC100363465RGD:2322980
    
    
     
n/achr4 38,927,916n/a
3Arl6ip4RGD:1307657
    
    
     
n/achr12 33,604,856n/a
4Nsfl1cRGD:619952
    
    
     
n/achr3 141,811,524forms a complex with p97 that facilitates phosphatidylethanolamine-mediated membrane fusion; involved in reorganization of Golgi cisternae after mitosis
5LOC100360548RGD:2321909
    
    
     
n/achr10 48,738,897n/a
6Zmym4RGD:1309545
    
    
     
n/achr5 146,325,977n/a
7NudcRGD:3215
    
    
     
n/achr5 151,542,970expression is induced by prolactin; highest expression occurs during the G1/S transition phase of the cell cycle
8Ptov1RGD:1306977
    
    
     
n/achr1 95,339,171n/a
9Kat5RGD:621061
    
    
     
n/achr1 208,237,086human homolog is a neurotoxic protein involved in facilitation of Myc-induced histone acetylation; believed to play a role in the development of AIDS-associated dementia
10Ppt1RGD:61994
    
    
     
n/achr5 142,163,449deficiency causes drastic neurodegeneration; may protect neurons from excitotoxicity; may mediate synaptic plasticity
11Cd81RGD:2315
    
    
     
n/achr1 203,335,094may play a role in glial scar formation in response to astrocyte injury; may be involved in regulation of cell interactions and cell growth
12Psmc1RGD:621097
    
    
     
n/achr6 124,387,157may play a role in ATP-dependent RNA/DNA unwinding
13Psmd4RGD:621109
    
    
     
n/achr2 189,937,791inhibits cholera-induced intestinal fluid secretion
14Hsp90aa1RGD:631409
    
    
     
n/achr6 135,416,381encodes a molecular chaperone;  involved in sequestering damaged proteins, ATP-dependent folding of proteins, cell migration, response to heat and several other biological processes
15LOC100362895RGD:2323884
    
    
     
n/achr5 145,207,004n/a
16LOC100361959RGD:2319121
    
    
     
n/achr14 22,622,650n/a
17LOC100360977RGD:2321083
    
    
     
n/achr14 22,613,138n/a
18Sart3RGD:1311646
    
    
     
n/achr12 43,907,308n/a
19Eftud2RGD:1560116
    
    
     
n/achr10 92,032,602n/a
20Atp6v0cRGD:621394
    
    
     
n/achr10 13,418,193subunit of vacuolar H(+)-ATPase
21Cdc37RGD:71006
    
    
     
n/achr8 20,170,456may play a role in regulation of the cell cycle
22Ehmt2RGD:1302972
    
    
     
n/achr20 4,027,694mouse homolog may act as a histone methyltransferase and may be involved in genetic imprinting
23LOC685634RGD:1591379
    
    
     
n/achr5 146,694,205n/a
24CltaRGD:70919
    
    
     
n/achr5 60,493,434light chain component of the clathrin triskelion structure of coated vesicles
25R3hcc1RGD:1311790
    
    
     
n/achr15 50,080,532n/a
26Smarcb1RGD:1308761
    
    
     
n/achr20 13,151,384mutation of the human homolog results in malignant rhabdoid tumor and other malignancies
27Ctbp1RGD:2441
    
    
     
n/achr14 83,036,579transcriptional co-repressor protein that may function in development, cell cycle regulation and cellular transformation; regulates tubulation of Golgi structures upon treatment with brefeldin A; interacts wth GTP, beta gamma subunits of G-proteins and viral EBNA3A protein
28Rbm10RGD:631366
    
    
     
n/achrX 12,973,683nuclear protein binds to RNA homopolymers with G and U polyribonucleotides
29Cops8RGD:1311404
    
    
     
n/achr9 89,807,377n/a
30Man2c1RGD:628787
    
    
     
n/achr8 60,892,913plays a role in the processing of asparagine-linked oligosaccharides
31Tbxa2rRGD:3825
    
    
     
n/achr7 9,870,137binds thromboxane and induces an increase in cytosolic Ca2+ levels; may play a role renal electrolyte metabolism; may mediate vascular smooth muscle cell contraction and proliferation
32Atg16l1RGD:1310631
    
    
     
n/achr9 86,729,746n/a
33Aqp9RGD:68433
    
    
     
n/achr8 75,631,565solute channel involved in passage of carbamides, polyols, purines, and pyrimidines
34Taf6RGD:1311608
    
    
     
n/achr12 17,625,084n/a
35Slc25a17RGD:1311498
    
    
     
n/achr7 119,667,766n/a
36Arrb2RGD:2157
    
    
     
n/achr10 57,264,118dampens responses to various stimuli by binding and desensitizing G protein-coupled receptors; regulates cAMP metabolism; involved in endocytosis
37Rasa2RGD:3538
    
    
     
n/achr8 101,675,809activates Ras GTPase
38HnrnpcRGD:1309982
    
    
     
n/achr15 27,531,742exhibits RNA binding and identical protein binding; involved in RNA splicing (homolog)
39RGD1310861RGD:1310861
    
    
     
n/achr12 35,397,541n/a
40Yipf3RGD:1308185
    
    
     
n/achr9 10,295,513n/a
41Nucb1RGD:620030
    
    
     
n/achr1 95,971,536extracellular calcium binding protein of the mineralized matrix of bone
42Chchd6RGD:1304561
    
    
     
n/achr4 123,569,920n/a
43Becn1RGD:620190
    
    
     
n/achr10 90,325,643mouse homolog is a haploinsufficient tumor suppressor gene; plays a role in early embryonic development
44Gsk3bRGD:70982
    
    
     
n/achr11 64,356,714mediates Par6-atypical protein kinase C (aPKC) complex regulation of cell polarity; may induce apoptosis
45RGD1311493RGD:1311493
    
    
     
n/achr10 91,371,792n/a
46PitpnbRGD:620143
    
    
     
n/achr12 45,410,392complements a yeast sec14 mutation; may act as a phosphotidylinositol transfer protein
47Unc50RGD:621749
    
    
     
n/achr9 36,379,598an inner nuclear membrane RNA-binding protein
48DarsRGD:621167
    
    
     
n/achr13 41,104,954the catalytic domain of rat liver aspartyl-tRNA synthetase
49Klhdc3RGD:1307105
    
    
     
n/achr9 10,048,931n/a
50Slc27a1RGD:620927
    
    
     
n/achr16 18,778,448involved in myocardial fatty acid uptake